开发工具:
文件大小: 169kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-09
详细说明：2021_pms_mt
该存储库包含用于对...的比较分析中使用的脚本。
download_mt_genomes_gc_hist
包含Snakefile是下载与efetch > 700个真菌基因组的MT，使每个MT基因组的GC含量直方图。 GenBank登录号和mt基因组的其他信息位于TSV文件table_mt_genomes.txt 。 转到此目录并运行：
snakemake -j 1 --use-conda
下载所有这些文件可能需要一段时间。 您可以尝试调整线程数（ -j ）以使其更快。
产生两个文件夹： mtgenomes ，其中包含fasta文件中的所有mt基因组，以及mtgenomes_gc_hists和PDF中的GC直方图。
introns_identity
R脚本用于对齐内含子并绘制％identity的热图。 内含子序列在文件intron_sequences.tar
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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