文件名称:
InSpace:用于工程学的UW星际iN原位预测算法（InSpace）旨在预测感兴趣细菌（BOI）在太空飞行条件下的相对生存能力。 数据来自NASA GeneLab-源码
开发工具:
文件大小: 3mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-09
详细说明：在太空
用例（直接）：
预测感兴趣细菌（BOI）在太空飞行条件下的相对生存力
预测航天条件下目标细菌（BOI）基因簇的表达谱
用例（隐式）：
查找BOI和测试/训练数据集之间的匹配基因/基因同源物
功能-使用“程序包A”将FASTA从数据集ENTREZ ID连接到BOI的NCBI BLAST
输入-BOI名称的字符串（属种）
输出-布尔值T / F，相似度百分比的浮动，以及对用户的说明字符串（例如T（40％）：至少有一个（或多个）匹配项-计算预测，F（0％）：“未找到匹配项，请指定其他细菌”）
从每个NASA数据集中提取匹配基因的表达和重要性数据
功能-将ENTREZ ID与所需的表达水平（log2FC）和重要性（p值）相匹配
输入-来自每个CSV（BS，EC，PA）的带标签的ENTREZ ID
输出-匹配基因的表达水平/重要性数据的已编译数据框
确定NASA GeneLab数
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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