文件名称:
FastMLST::high_voltage::dna:FastMLST-源码
开发工具:
文件大小: 27kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-07
详细说明:快速MLST
多核多基因座序列分型工具,结合等位基因串联。
介绍
FastMLST是用Python3编写的高速独立脚本,它采用FASTA格式的程序集(也允许压缩),并根据定义的MLST方案确定其ST。 与其他ST确定程序相比,主要优点是FastMLST允许生成FASTA文件,该文件包含所有已分析的基因组的串联等位基因,这些基因组已准备好进行比对并用于系统发育推断。
您可以在我们的阅读有关MLST分析的完整指南。
安装
当前,安装此脚本的唯一方法是使用Conda。
conda config --add channels defaults
conda config --add channels conda-forge
conda config --add channels bioconda
conda install fastmlst
依存关系
预期使用conda进行安装时,所有依赖项都
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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