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上传时间: 2021-03-07
详细说明：本文选取了47种鸟类的基因组作为研究对象，根据靶定下一代DNA测序技术(targeted next-generation DNA sequencing)得到的394个保守片段的DNA序列数据，统计了从9联体到14联体的频数及其频率，基于k联体(k-mer)非联配算法得到了任意两种鸟类之间k联体的距离矩阵,并运用邻接(Neighbor-Joining).法构建了47种鸟类的进化树，发现当k = 12时达到稳定。最后，通过将该树与Prum和Jarvis构建的进化树进行了比较，分析了鸟类的进化和分类. 结果发现三个进化树基本一致, 只有部分姐妹分支有差别, 说明12联体的相对频数是能够较好描述基因组进化的动力学变量。
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