文件名称:
pandapenguin:用于2P实验容器直径测量的脚本-源码
开发工具:
文件大小: 64mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-06
详细说明：熊猫企鹅
此回购包含用于两个光子实验和数据分析的多种工具。 在根文件夹中，它包含几乎所有两个光子实验所需的功能。 对于每个实验，首先需要将config.yml复制到每个实验文件夹（运行）。 该文件定义信号是否需要降噪，配准以及需要使用哪些功能，以及与这些步骤相关的一些基本参数。 您可以手动复制，也可以使用build_config函数将config.yml复制到一系列运行中。 如果需要进行注册，则需要运行build_registration_ref为每次实验运行创建ref.tif。 将config.yml复制到实验文件夹并进行修改，并可能完成了注册的注册后，您可以使用load_parameters来加载用于预处理的参数，以进行预处理。 这将输出一个XXX_XXX_XXX_preprocessor.tif。 该文件将准备进行进一步的分析。 除基本功能外，所有预处理功能都位于pretreat文件
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