开发工具:
文件大小: 560kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-05
详细说明：介绍
eQTLsingle是一个R软件包，用于从scRNA-seq数据中发现eQTL效应。 它通过检测特定细胞类型内不同基因型之间的差异基因表达来发现细胞类型特异性eQTL。
eQTLsingle具有两种模式。
清除数据模式：将输入作为单个单元格的SNV矩阵和表达矩阵
原始数据模式：将输入作为fastq文件。 eQTLsingle可以同时生成SNV矩阵和基因矩阵，用于进一步的eQTL发现分析
安装
要从安装eQTLsingle ：
if ( ! require( devtools )) install.packages( " devtools " )
devtools :: install_github( " horsedayday/eQTLsingle " , build_vignettes = TRUE )
要在R中加载已安装的eQTLsingle ，请执行以下操作：
lib
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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