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上传时间: 2021-03-05
详细说明：染色质网络延缓液滴聚结
这是用于建立分子动力学（MD）模拟的核心脚本的资料库，该论文在“染色质网络延迟液滴合并”中进行了详细介绍。
第一步是设置MD仿真器大规模原子/分子大规模并行仿真器（ ），这是用于MD仿真的开源计算包。 可以在下载标准的LAMMPS软件包（压缩文件） 并按照LAMMPS的文档进行下载以构建LAMMPS目录。 我们一直在使用版本，在该版本上我们进行了自定义修改。
下载标准的LAMMPS软件包后，将中的自定义修改复制到下载的软件包的目录/ LAMMPS / src /中并进行编译。
请注意，需要预先安装编译器，并且需要环境来编译LAMMPS的并行版本。
在“普通”台式计算机上，典型的安装时间（包括下载和编译步骤）约为5至10分钟。
LAMMPS的编译后，直接在二进制文件 （第11行），并执行来模拟轨迹 。 可以通过更改 （第17行）中的运行索引并重新执行代码来
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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