文件名称:
寻找RNA：全面的质量控制和定量RNA-seq流程-源码
开发工具:
文件大小: 6mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-04
详细说明：寻求RNA
用于分析RNA序列数据的开源，可复制和可扩展的解决方案。
目录
2.1 2.22.32.4
3.13.2 3.3
1.简介
RNA测序（ RNA-seq ）具有广泛的应用。 这种流行的转录组分析技术可用于定量基因和同工型表达，检测其他剪接事件，预测基因融合，调用变体等等。
RNA-seek是一个全面的开放源代码RNA-seq管道，它依赖于诸如和来保持最高水平的可重复性。 该管道包括由精心策划的一系列数据处理和质量控制步骤， 是一种灵活且可扩展的工作流管理系统，用于将作业提交给集群或云提供商。
图1.在计算实例上本地运行，使用群集在本地运行，或使用AWS在云上运行。 用户可以定义执行的方法或模式。 管道可以使用作业调度程序（例如SLURM）将作业提交到集群，也可以使用Tibanna在AWS上运行（功能即将推出！）。 混合方法可确保所有用户均可访问管道。 作为可选步骤，可以
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