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每个基因座的基因选择：在一组基因中选择最可能的因果疾病基因-源码
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文件大小: 1mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-04
详细说明：基因评分后每个基因座的基因选择
总体目标：在GWAS之后选择每个基因座的最高基因（全基因组关联研究）
基因以前已经过机器学习，可以根据基因是否可能导致血压来对基因进行排名
基因按位点分组（发现基因组区域对血压表型具有统计学意义），因此此代码的目的是根据以下概述的标准在每个组/基因座中选择最佳基因。
筛选以选择每个基因座的基因，如果它们是：
机器学习预测（RF_Score）> +1标准偏差（SD）。 如果不满足1.，则：
选择>平均得分的基因以通过蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）进行进一步过滤
选择具有已知疾病基因的最高直接PPI（direct_PPI_count）的基因，或者如果直接PPI在输入的基因之间匹配则选择4。
选择具有已知疾病基因的次要PPI最高的基因（secondary_PPI_count），或者如果仍然有匹配的PPI计数，则选择基因，进入步骤5。
选择所有与PPI
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