文件名称:
鲑鱼:使用选择性比对,可从RNA-seq读取物中进行高精度且快速的转录本水平定量-源码
开发工具:
文件大小: 7mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-03
详细说明:试用alevin(鲑鱼的单细胞处理模块)! 开始学习本
试用新的框架进行单细胞分析!
帮助指导鲑鱼的发展,
预先计算的诱饵转录组
tl; dr:快速是好的,但是快速和准确的更好! 尽管预先计算的诱饵(<= v.14.2)仍与最新的主要发行版(v1.0.0)兼容。 我们建议您使用完整的基因组更新索引,因为它可以提供更高的准确性。 有关更多信息,请在最新修订的预印本查看我们的广泛基准测试,以比较不同的比对方法及其在RNA-seq定量方面的性能。 请使用该的逐步指南,了解如何有效地索引参考转录组和基因组,以进行基于准确的双端核糖核酸的RNA序列定量。
具体来说,可以通过3种可能的方式创建鲑鱼指数:
仅限cDNA的索引:salmon_index- ://combine-lab.github.io/salmon/getting_started/。 此方法将产生最小的索引,并需要最少的资源来构
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
相关说明
- 本站资源为会员上传分享交流与学习,如有侵犯您的权益,请联系我们删除.
- 本站是交换下载平台,提供交流渠道,下载内容来自于网络,除下载问题外,其它问题请自行百度。
- 本站已设置防盗链,请勿用迅雷、QQ旋风等多线程下载软件下载资源,下载后用WinRAR最新版进行解压.
- 如果您发现内容无法下载,请稍后再次尝试;或者到消费记录里找到下载记录反馈给我们.
- 下载后发现下载的内容跟说明不相乎,请到消费记录里找到下载记录反馈给我们,经确认后退回积分.
- 如下载前有疑问,可以通过点击"提供者"的名字,查看对方的联系方式,联系对方咨询.