开发工具:
文件大小: 1mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-01
详细说明：电子技术
在单个Pyomo建模框架中构建酶促和热力学约束GEM的脚本。
环境
这些脚本是使用Python 3.5.5编写和测试的。
管道必不可少的核心库包括：
Cobrapy工具箱：--0.13.3版本（推荐，因为最新版本已删除了必需的“ convert_to_irreversversible”功能）；
Pyomo软件包：--5.7版；
Gurobi求解器：版本--9.0.2;
此外，还有熊猫和相关包装。
软件
Requirements.txt中列出了用于运行管道的软件包。 要使用pip安装要求，请在命令行上运行以下代码：
$ pip install -r requirements.txt
要使用Python 3.5.5和所有必需的软件包版本（尤其是cobrapy也可用）创建名为ETGEMs的独立环境，请运行以下代码：
$ conda create -n ETGEMs py
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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