文件名称:
funannotate:真核基因组注释管道-源码
开发工具:
文件大小: 537kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-28
详细说明:funannotate是用于基因组注释的管道(专门为真菌构建,但也可用于高级真核生物)。 有关安装,使用和更多信息,请参见
最快启动Docker:
您可以使用funannotate运行funannotate 。 需要注意的是,GeneMark不包含在Docker映像中(请参阅下面的许可,您可以向开发人员投诉,因为它难以分发/使用)。 我还编写了一个bash脚本,该脚本可以运行docker映像并自动检测/包括正确的用户/卷绑定。 该docker映像是基于master中的最新代码构建的,因此它将早于标记的发行版。 该映像还包括所需的数据库,如果您只想在没有数据库的情况下进行注解,则该映像位于nextgenusfs/funannotate-slim hub以及nextgenusfs/funannotate-slim 。 因此,可以通过以下方式实现此路线:
# download/pull th
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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