文件名称:
管道GBS：Snakemake GBS管道-源码
开发工具:
文件大小: 72kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-28
详细说明：管道GBS
基于GBS-SNP-Crop的snakemake管道得到进一步扩展。
配置
管道参数配置在文件中进行
GBS-pipeline_config.yaml （这里有一个示例： GBS-pipeline_config-example.yaml ）
此外，此处定义了对计算集群重要的设置：
GBS-pipeline_server-config.yaml （例如： GBS-pipeline_puhti-config.yaml ）
启动管道
在开始管道之前，请确保已创建此文件中定义的相应的conda环境。
GBS.yaml
创建环境后，就可以开始使用了。
要启动管道，只需键入
bash runGBSPipeline-example.sh
您可以通过运行启动空运行
bash runGBSPipeline-example.sh -np
当前状态
该管道目前正在积极开发中，可能无法
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
相关说明
- 本站资源为会员上传分享交流与学习,如有侵犯您的权益,请联系我们删除.
- 本站是交换下载平台，提供交流渠道，下载内容来自于网络，除下载问题外，其它问题请自行百度。
- 本站已设置防盗链，请勿用迅雷、QQ旋风等多线程下载软件下载资源，下载后用WinRAR最新版进行解压.
- 如果您发现内容无法下载，请稍后再次尝试；或者到消费记录里找到下载记录反馈给我们.
- 下载后发现下载的内容跟说明不相乎，请到消费记录里找到下载记录反馈给我们，经确认后退回积分.
- 如下载前有疑问，可以通过点击"提供者"的名字，查看对方的联系方式，联系对方咨询.
