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文件大小: 2mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-27
详细说明：Layer Lab NGS分析工作流程（用于CHCO）
PLEASE NOTE THAT THIS IS VERY MUCH A WORK IN PROGRESS AND THE CONFIGURATION AND THE CODE MIGHT NEED TWEAKING BEFORE RUNNING THE PIPELINE
该管道在实现，并实现以下工作流程。
胚芽
短插入
复制号码变型呼叫者
体细胞的
短插入
此工作流程适用于正常肿瘤和仅肿瘤（单样本模式）方案。
复制号码变型呼叫者
（基于未读信号）
管道架构
以下是管道的主要组成部分
Nextflow是包装各个流程（分析的各个组成部分，例如bwa-mem）并协调工作流程的主要粘合剂
配置文件（在conf目录下）承载了nextflow用来确定使用哪个（执行机制）来运行管道的信息
包装在nextflow processes各个脚本
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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