文件名称:
opentims：用于打开二进制timsTOF数据文件的开源C ++和Python模块-源码
开发工具:
文件大小: 2mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-26
详细说明：OpenTIMS
OpenTIMS是一个用于访问timsTOF Pro数据格式（TDF）的C ++库。 为了数据访问的目的，它（在很大程度上）替代了Bruker的SDK，并提供了方便的层以集成到更高级别的计算机语言中。 它带有对Python （通过opentimspy ）和R语言（通过opentimsr ）的绑定。 在Python ，我们将数据提取到针对速度进行了优化的NumPy数组中，并提供了一系列有用的方法来对其进行快速操作。 在R ，我们将数据提取到本地data.frame对象中。
使用OpenTIMS您可以访问由您选择的质谱仪（只要是timsTOF Pro）愉快地产生的analysis.tdf_raw文件中包含的analysis.tdf_raw 。 它还从analysis.raw文件中包含的SQLite数据库中解析出一些信息。 您应该在一个文件夹中同时拥有这两个文件，才能开始使
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