文件名称:
第3组:组长:Ryan McMinds,Jesper Madsen-源码
开发工具:
文件大小: 8mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-25
详细说明:项目名称:病毒时空
团队负责人:Ryan McMinds,Jesper Madsen
团队成员:Ann Mathew,Sofia Bhatia,Samuel Coleman,Omkar Dokur,Janelle Donglasan
GVN / USF导师:Alash'le G. Abimiku博士
目标
将地理空间数据集与病毒进化速率关联
方法与实现
第一关:
下载NextStrain美国子集系统发育,包括时间尺度和分歧尺度的分支长度,以及尖端的地理位置。
估算边缘的平均地理位置。
第一个插补祖先节点作为直接后代节点/尖端之间的最短大圆弧上的一个点。 从技巧开始,然后迭代到树的根。 每个祖先的点对应于与时间尺度分支长度成比例的位置(例如,如果一个后代边缘的长度为2,而另一个后沿的长度为1,则该点是从后代1到后代2的距离的1/3。
然后将边缘的平均位置估算为祖先和后代之间的中点
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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