文件名称:
rexmapdb：RExMap数据库-源码
开发工具:
文件大小: 45mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-24
详细说明：RExMap数据库
这些说明描述了如何从头开始构建RExMap数据库。 它遵循以下过程：
首先，克隆存储库：
git clone https://github.com/taolonglab/rexmapdb.git
cd rexmapdb
要运行这些脚本，您需要：
已安装RExMap： :
Python 3，安装了模块Biopython和Pandas
元数据
下载细菌和古细菌基因组装配体的NCBI Genome数据库元数据，并为每个独特菌株仅选择最佳装配体：
python3 py/dl_genome_meta.py data/
这将首先下载两个文件：
data/archaea_assembly_summary_2018-05-20.txt
data/bacteria_assembly_summary_2018-05-20.txt
然后生成具有唯一应变名称的过滤后的装配摘
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
相关说明
- 本站资源为会员上传分享交流与学习,如有侵犯您的权益,请联系我们删除.
- 本站是交换下载平台，提供交流渠道，下载内容来自于网络，除下载问题外，其它问题请自行百度。
- 本站已设置防盗链，请勿用迅雷、QQ旋风等多线程下载软件下载资源，下载后用WinRAR最新版进行解压.
- 如果您发现内容无法下载，请稍后再次尝试；或者到消费记录里找到下载记录反馈给我们.
- 下载后发现下载的内容跟说明不相乎，请到消费记录里找到下载记录反馈给我们，经确认后退回积分.
- 如下载前有疑问，可以通过点击"提供者"的名字，查看对方的联系方式，联系对方咨询.
