开发工具:
文件大小: 9kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-24
详细说明：MD-TM_工具
研究跨膜螺旋性质。
特征
calc_angles.py可以：
计算简单结构或轨迹的两个跨膜螺旋之间的交叉角
计算简单结构或轨迹的倾斜角
calc_resi-dist.py可以：
计算两个跨膜螺旋原子之间定义的截止距离的所有距离用来确定临界值以便随后建立联系图
计算轨迹上发现的每个残基对的频率用于建立联系方式
要求
运行脚本必须使用Python> = 3.6。
该脚本是用Python 3编写的，需要以下模块：
argparse
麻木
数学
系统
MD分析。
安装（开发）
安装conda（与Miniconda或Anaconda一起使用，我们建议使用Miniconda）
克隆此GitHub存储库：
$ git clone https://github.com/rversin/MD-TM_tools.git
创建conda环境：
$ conda env crea
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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