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文件名称: WebGMAP:用于将cDNA序列映射和比对基因组的Web服务
  所属分类: 其它
  开发工具:
  文件大小: 2mb
  下载次数: 0
  上传时间: 2021-02-23
  提 供 者: weixin_********
 详细说明:数以千计的生物的基因组通常都伴随着cDNA或EST的序列进行测序。 生物信息学的重大挑战之一是使这些基因组序列和基因组注释以一种用户友好的方式可供普通生物学家使用,以解决有趣的生物学问题。 我们已经创建了一个名为WebGMAP(http://www.bioinfolab.org/software/webgmap)的开放式Web服务,该服务将cDNA基因组比对工具(例如GMAP)与易于使用的数据可视化和挖掘工具无缝地集成在一起。 。 该Web服务旨在促进社区努力,以改善基因组注释,确定准确的基因结构及其变异,以及探索重要的生物学过程,例如可变剪接和可变聚腺苷酸化。 对于常规序列分析,WebGMAP为基于Web的序列查看器提供了许多有用的功能,包括核苷酸定位,六帧翻译,序列反向互补以及不完美的基序检测和比对。 WebGMAP还为用户提供了分类,过滤和搜索单个cDNA序列和cDNA基因组比对的功能。 我们的EST-Genome-Browser可以在100到50,000 nt的范围内显示带注释的基因结构和cDNA-基因组比对。 我们的EST-Genome-Browser能够突出查询cDNA与基
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