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通过深度测序揭示植物中发育和环境响应中的交替聚腺苷酸化作用而产生的转录组动力学
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上传时间: 2021-02-23
详细说明：聚腺苷酸化位点标记mRNA转录物的末端。 替代的聚腺苷酸化（APA）可能会改变序列元素和/或转录本的编码能力，该机制已被证明可调节基因表达和转录组多样性。 为了研究APA在转录组动力学中的作用，我们分析了RNA的大规模数据集表示聚（A）位点和mRNA表达水平的“标签”。 这些标签来自突变或暴露于环境处理的各种组织和发育阶段，并使用基于数字基因表达（DGE）的大规模平行签名测序（MPSS-DGE）和Illumina合成测序方案生成（SBS-DGE）测序平台。 数据提供了APA的全局视图以及它如何促进转录组动力学。 分析这些数据后，我们发现约60％的拟南芥基因具有多个poly（A）位点。相反，约有
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