文件名称:
大豆基因组中新型MicroRNA基因的计算机检测
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文件大小: 484kb
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上传时间: 2021-02-23
详细说明：microRNA（miRNA）在转录后调控水平上的重要性最近已在动植物中得到公认。 在这项研究中，使用了简单而最有效的比较基因组方法。 首先针对大豆基因组的已知植物miRNA BLAST，然后通过RNA折叠方法在候选的附近（+/- 400 nt）搜索定位的候选miRNA。 结果表明，总共鉴定出521个新的大豆miRNA基因，包括236个成熟的miRNA。 所有这些成熟的miRNA分为58个家族，其中21个是大豆中的新家族。 为了研究miRNA的预测并检测转录本单位和聚类，将上游2 000 nt的潜在pre-miRNA用于启动子预测。 在这项研究中，miRNA基因较少出现在大豆簇中。 作为多顺反子转录物的一部分，仅观察到9个簇，其中包含21个miRNA基因（占总数的4.0％）。 对大豆和所有先前已知的植物miRNA中的新型miRNA的序列特征进行了详细分析。 这项研究的结果为进一步研究植物中的miRNAs提供参考，并提高了对大豆基因组的了解。
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