文件名称:
nextflow_pipelines：Babraham中使用的NGS处理管道集-源码
开发工具:
文件大小: 4mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-22
详细说明：Babraham Nextflow管道
介绍
该存储库包含用于大量处理NGS数据的nextflow管道。 这些管道旨在在我们集群的环境中工作，但可以很容易地使其在其他地方工作。
这些管道使运行大量序列的标准处理变得容易。 它们通常分为以下两种类型之一：
用于完整处理特定类型数据（例如nf_rnaseq ）的nf_rnaseq ，它将运行多个链接的程序
运行单个程序的管道（例如nf_fastq_screen ），在需要更有限的处理时很有用
所有管道均设计为可直接执行，并且其中许多管道只需要提供一组fastq文件即可处理。 任何执行定位步骤的人都将需要提供基因组的详细信息进行处理。 可以在此找
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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