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上传时间: 2021-02-21
详细说明:输出
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MuRD:通过整合来自单细胞参考和外部表达数据的信息,对大RNA测序数据进行多鲁棒细胞型反褶积
MuRD统一了多种解卷积方案,可从目标大量RNA-seq数据推断细胞类型比例。 该算法具有三个独特的功能:首先, MuRD能够整合来自外部数据源的额外生物学信息(例如,来自独立研究的scRNA_seq和其他大量RNA_seq数据); 其次, MuRD通过考虑基于参考的方法的比例估计来校准无参考算法; 第三, MuRD对于来自任何提供的数据源的错误信息具有鲁棒性。
安装
您可以使用以下命令安装发行版的MuRD:
#install devtools if nece
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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