文件名称:
metabolomics_modeling：旨在鉴定可预测缺血性和再灌注事件的代谢物的研究项目-源码
开发工具:
文件大小: 524kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-20
详细说明：代谢组学模型
该项目旨在鉴定可预测缺血/再灌注事件的代谢物，并确定人源素治疗是否会显着改变血液代谢组学。 该数据集包含有关14个动物受试者中4个时间点上736个代谢组学测量值的信息。 这些受试者中有七个属于人源激素治疗组。 其余的属于对照组。
这项研究有两个主要阶段：
根据代谢组学数据预测受试者是治疗组还是对照组。
使用跨时间序列数据的代谢物测量值预测缺血事件的阶段。
该项目的一些不错的结果：
自动化所有功能工程和参数测试脚本
确定了5种可以很好地预测缺血事件的代谢物，从而可能节省+ 50k的成本
开发了基于ANOVA的特征选择方法，该方法将基本模型的准确性从35％提高到了85.7％（有用的工具，可以防止在小型数据集上过度拟合！）
治疗与对照组分析
为了了解人类素治疗与各种代谢物测量值之间的关系，我们建立了梯度增强树（GBT）模型，根据其在四个时间点的代谢物浓度预测给定的猪在治疗
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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