文件名称:
Variant_annotation_VCF-源码
开发工具:
文件大小: 1mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-20
详细说明：Variant_annotation_VCF
一个小型软件程序，用于输出CVS表和VCF文件，并带有输入VCF文件中每个变体的注释。 每个变体的其他信息可通过ExAC获得。 为了加快计算速度，使用ExAC API批量查询变量，然后将注释信息首先存储在列表中，然后附加到数据帧中。
相关性：
语言：python 3
使用的包：json，argparse，请求，熊猫，numpy，os.path
带注释的信息
在变化的位置读取深度；
支持变体的阅读次数；
支持变体的读物（AO）与支持参考读物的读物（RO）；
EXaC的变体的等位基因频率；
来自EXaC的变体的后果：当有多种后果可用时，选
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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