文件名称:
aws_batch_genomics_step_function-源码
开发工具:
文件大小: 42kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-19
详细说明：AWS上的基因组学研究
该项目演示了如何使用和在上运行大规模的基因组学二级分析管道。 您可以在我们的博客文章“ 了解有关如何将新的AWS Step Functions集成与AWS Batch一起使用的更多信息。
前提条件
部署管理员权限
部署
将构建和部署在AWS上运行二级分析管道所需的一切。 这包括：
使用您所在地区的ECS AMI，具有1TB暂存卷的自定义AMI （10分钟）
Isaac，Strelka，Samtools-Stats和SnpEff作为ECR中的Docker映像（40分钟）
AWS Batch队列，计算环境，作业定义和AWS Step Functions状态机（10分钟）
需要角色和存储桶。
$ setup.sh
用法
运行工作流程
部署完成后，将输出的工作流输入复制到终端窗口。 使用该输入在StepFunctions控制台中运行管道。 您还可以在batch-g
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
相关说明
- 本站资源为会员上传分享交流与学习,如有侵犯您的权益,请联系我们删除.
- 本站是交换下载平台，提供交流渠道，下载内容来自于网络，除下载问题外，其它问题请自行百度。
- 本站已设置防盗链，请勿用迅雷、QQ旋风等多线程下载软件下载资源，下载后用WinRAR最新版进行解压.
- 如果您发现内容无法下载，请稍后再次尝试；或者到消费记录里找到下载记录反馈给我们.
- 下载后发现下载的内容跟说明不相乎，请到消费记录里找到下载记录反馈给我们，经确认后退回积分.
- 如下载前有疑问，可以通过点击"提供者"的名字，查看对方的联系方式，联系对方咨询.
