文件名称:
nbt_spatial_backmapping:手稿的代码源:单细胞表达分析和空间映射到起源组织-源码
开发工具:
文件大小: 37kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-18
详细说明:单细胞表达谱分析和空间映射到起源组织
您将在此存储库中找到用于执行手稿中提供的分析的R源代码。 将使用简单(组成)的示例数据集来介绍不同的功能和全局工作流程。 也可以使用手稿中使用的数据,但需要更多的计算能力。
下面介绍的工作流没有详细介绍所使用的功能,为此,请参见文件spatial_mapping.R的带注释的代码。
示例数据集
示例数据集位于example_dataset文件夹中,您可以通过将项目下载为.zip文件或克隆计算机上的git存储库来获取它们。 示例数据集分为3个文件:
example_data_RNA_seq.csv :包含10个细胞(行)和10个基因(列)的一些假RNA-
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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