文件名称:
BERT-Kcr:使用BERT神经网络的转移学习方法预测赖氨酸的巴豆酰化位点-源码
开发工具:
文件大小: 13mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-17
详细说明:伯特·克尔
基于转移学习方法的预训练BERT模型预测组蛋白赖氨酸巴豆酰化(Kcr)位点
所有数据集都在BERT-Kcr /数据中。
所有模型均可在:
(1)BERT-Base模型是原始的预训练BERT模型,它包含12个变压器层和768个隐藏的嵌入大小。
(2)BERT-Kcr模型是我们对组蛋白Kcr部位预测的最终模型。
所有代码均在BERT-Kcr /代码中:
(1)如果要训练BERT-Kcr模型,请确保已下载上述BERT-Base模型,然后应该:
A.格式化您的训练和验证文件,例如BERT-Kcr / code / input文件夹中的文件。
B.修改BERT-Kcr / code / train.sh中的文件夹路径,然后运行:
bash train.sh
(2)如果要使用BERT-Kcr模型预测组蛋白Kcr站点,请确保已下载上述两个模型,然后应该:
A.格式化测试
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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