文件名称:
TreehopperSeq：实用程序脚本，数据分析管道以及带有非模型生物的RNA-Seq的文档的集合-源码
开发工具:
文件大小: 10mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-17
详细说明：TreehopperSeq
实用程序脚本，数据分析管道和非模型生物RNA-Seq的文档的集合。
此仓库中使用的软件：
三位一体（trinityRNAseq）/领结/ RSEM
TRIMMOMATIC
领结2
EnTAP
R（生物导体包装）
RNA-Seq读取处理管线
TODO为RNA QC管道和自述文件添加脚本。
高质量修剪显示为“完成”
条PolyA尾巴完成
集合
制作小的测试数据集
注释和装配优化
TODO添加用于使用EnTAP注释读段的脚本，使用USEARCH来聚簇蛋白质组，并添加脚本来选择代表聚簇蛋白质组（改良的程序集）的核苷酸序列。
文件包括一个R Notebook
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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