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文件大小: 325kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-16
详细说明:马斯特2021
大纲
用于分析MAESTER数据的脚本集合。 此大纲(也是本文的补充图5)显示了如何使用脚本。
1_预处理
过滤细胞条形码(CB),并从Read 2 fastq的读取ID中的Read 1 fastq生成具有CB和唯一分子标识符(UMI)的fastq文件。 assembleFastq.PvG210215.R
对齐后,获取bam文件,并将读取的ID中的CB和UMI添加为bam标签。 Tag_CB_UMI.PvG191004.sh
通过执行额外的QC并生成野生型/突变细胞表来处理IronThrone-GoT摘要表。 201116_GoT_QC.R
取得MAEGATK的输出,并沿
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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