文件名称:
ROAD：ROAD使用RNA折纸方法促进了RNA纳米结构的设计-源码
开发工具:
文件大小: 254kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-14
详细说明：道路：RNA折纸自动化设计
ROAD软件包使用RNA折纸方法使RNA纳米结构的设计自动化，并包括以下主要程序：
RNAbuild-从蓝图生成3D PDB坐标文件。
左轮手枪-重复突变随机化的RNA起始序列，直到在ViennaRNA折叠模型下折叠成目标2D结构。
Batch_revolvr-多次运行Revolvr以为同一蓝图创建不同的候选设计。
RNAvis-分析和设计蓝图中的一条潜在折叠路径并设置其动画效果。
flip_trace-在所有四个可能的方向上输出一个蓝图。
trace_analysis-解析蓝图并输出分析和该蓝图的有用变体。
trace_pattern-解析一个蓝图，并输出该蓝图中的结构的点-原义符号以及序列约束。 它为左轮手枪创建输入。
跟踪-边线序列上的蓝图。 仅由左轮手枪使用。
引用路
在出版物中使用此软件时，请引用：
安装要求：
要运行RNAbu
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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