文件名称:
chm13_meth:chm13装配体中chrx的甲基化分析-源码
开发工具:
文件大小: 13mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-12
详细说明:chm13_meth
chm13装配体着丝粒与整个染色体的甲基化分析
依存关系
knitr tidyverse bsseq Biostrings GenomicRanges Rsamtools Sushi纳米Kong-甲基化实用程序
生成输入文件
调用甲基化染色体
nanopolish call-methylation -t 8 -r albacore_output.fastq -b albacore_output.sorted.bam -g reference.fasta -w "chr8" > chr8_methylation_calls.tsv
scripts/calculate_methylation_frequency.py -i methylation_calls.tsv > chr8_methylation_frequency.tsv
使用Isac的回购纳米Kong甲基化实
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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