文件名称:
转换：用于对从DC提取的数据实施转换的Python代码-源码
开发工具:
文件大小: 158kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-12
详细说明：该存储库的目标是提供独立的代码，使任何人都可以执行端到端ETL，从DC开始到最终可以上传到BQ的.jsonl文件结束。
转换和合并代码还会生成有关数据问题的日志，然后可以将这些日志传送到DC。
转换流
带有注释的示例患者数据，解释数据的协调，记录和合并
原始案例文件： ， ， ，
安装
克隆存储库并安装
git clone gitgithub.com:CancerDataAggregator/transform.git
pip install -e .
要么
git clone https://github.com/CancerDataAggregator/transform.git
pip install -e
从DC提取原始JSONL
extract-*程序用于从DC提取数据。 例如， extract-gdc用于从GDC提取数据。 使用extract-gdc -h获取使用信
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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