文件名称:
Tempora：用于时序scRNAseq数据的基于路径的轨迹推断方法-源码
开发工具:
文件大小: 30kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-11
详细说明：Tempora：使用时间序列单细胞RNA测序数据推断细胞轨迹
介绍
Tempora是一种新颖的细胞轨迹推断方法，它使用来自时间序列scRNAseq数据的时间信息对细胞进行排序。 Tempora使用生物途径信息来帮助识别细胞类型关系，并可以识别重要的时间依赖性途径来帮助解释推断的轨迹。
用法
安装
您可以使用devtools安装Tempora：
if ( ! require( ' devtools ' )) {
# install devtools
install.packages( " devtools " )
}
# install Tempora
devtools :: install_github( " BaderLab/Tempora " )
library( Tempora )
样本数据
Tempora软件包已使用以下三个数据集进行了验证：人骨骼肌成肌细胞的体外分化，鼠
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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