文件名称:
hugedb_framework_code_example：Markdown文档，其中涉及分子生物学方法中使用VastDB框架的案例-源码
开发工具:
文件大小: 17mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-11
详细说明：VastDB案例示例：哺乳动物中保守的Srrm4目标的鉴定和表征
本文档是《使用浩瀚工具和VastDB框架进行可变剪接的计算分析》一书的随附书。 在那里，我们展示了如何使用broadDB框架中的工具和资源（参见下图）（i）使用RNA序列数据（）量化AS并鉴定差异剪接的AS事件，（ii）执行多个基因组以及对AS事件集进行序列分析（ ），（iii）识别物种间具有基因组和法规保守性的AS事件（ ），以及（iv）帮助对结果进行生物学解释，最终鉴定设计湿实验室实验的有趣的AS事件（ 和 ）。
VastDB框架：大量工具Matt和ExOrthist的不同模块和命令的示意图，以及VastDB和PastDB中涵盖的不同信息层。
本教程将引导读者阅读第6节：将微外显子识别为剪接因子Srrm4的主要目标的代码示例。
目录
1. VastDB ： Srrm4在不同细胞和组织类型中的表达
的VastDB证
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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