文件名称:
rnasa：用于RNA序列样品的基因表达分析仪-源码
开发工具:
文件大小: 16kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-11
详细说明：纳萨
用于RNA序列样品的基因表达分析仪
安装
$ pip install -U https://github.com/dceoy/rnasa/archive/main.tar.gz
相关命令：
pigz
pbzip2
bgzip
samtools
java
fastqc
trim_galore
STAR
rsem-refseq-extract-primary-assembly
rsem-prepare-reference
rsem-calculate-expression
Docker镜像
从提取映像。
$ docker image pull dceoy/rnasa
用法
下载和处理资源数据。
$ rnasa download --genome=GRCh38 --dest-dir=/path/to/ref
运行管道进行基因表达分析。
$ rnasa run
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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