文件名称:
MHC-Imputation-Accuracy：有关评估MHC地区基因型插补准确性的硕士项目-源码
开发工具:
文件大小: 19kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-10
详细说明：MHC输入准确度
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介绍
传统上，全基因组关联研究（GWAS）使用基因分型阵列对大型个体（通常是病例和对照）进行基因分型，以确定哪些SNP在病例中明显超标，以鉴定与疾病的关联。 基因分型阵列比测序便宜，但仅“测量”标签或整个基因组中选定的SNP（最多250万个SNP）。 为了增加每个个体可用的SNP数量，可以使用相关群体的全基因组序列数据参考面板从阵列上的SNP中估算SNP。 这可以归因于SNP的非随机继承或连锁不平衡（LD）。可以采用几种方法进行插补，还有几种不同的参考面板。
人类基因组中的某些区域具有较高的变异性，因此可能难以估算。 这包括主要的组织相容性（MHC）地区。 该项目将研究不同的阵列，插补工具和参考面板，以评估包括欧洲和非洲在内的不同人口在MHC地区插补的准确性。 非洲人口具有较高的多样性，因此更难与人合作。一旦推算出该项目，便可以表征和比较各
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