文件名称:
ParticleChromo3D：使用粒子群算法构建染色体三维结构-源码
开发工具:
文件大小: 138mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-10
详细说明：ParticleChromo3D-从Hi-C数据预测染色体和基因组3D结构的粒子群优化
OluwadareLab，科罗拉多大学，科罗拉多斯普林斯
开发人员： 大卫·瓦德尼斯（David Vadnais） 计算机科学系科罗拉多大学科罗拉多斯普林斯分校电子邮件： 米歇尔·米德尔顿计算机科学系科罗拉多大学科罗拉多斯普林斯分校电子邮件：
联系： Oluwatosin Oluwadare博士计算机科学系科罗拉多大学科罗拉多斯普林斯分校电子邮件：
1.文件夹内容：
src：使用Python源代码和实用程序。
输入和模型：使用的合成和真实Hi-C数据集。
结果：为执行的所有实验生成了输出结构。
2.本研究中使用的Hi-C数据：
在我们的研究中，我们使用了的综合数据集。 从下载了本研究中使用的联系图，原始模型及其重建模型。
GM12878单元格Hi-C数据集，GEO登录号GSE63525
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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