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上传时间: 2021-02-10
详细说明:使用EISA的SITA分析管道
使用选定实验条件的外显子-内含子分裂分析(EISA)进行成对比较可视化和应力诱导转录衰减(SITA)分析的管道。 该管道使用编写,并具有Python和R脚本,适合与HPC系统一起使用。
目录
待定
背景
SITA是在压力诱导后细胞中快速诱导的过程,引起全局转录变化,其中下调的基因比例远大于此过程中上调的基因比例。 待定
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建立
剧本
待定
目录结构
由于该管道旨在在每次运行时处理单个GSE的所有选定SRR / GSM,因此当前有必要遵循以下目录体系结构。 每个GSE都有一个单独的文件夹,其中包含S
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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