文件名称:
circRNA：circularRNA检测-源码
开发工具:
文件大小: 2mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-09
详细说明：环RNA
该circularRNA检测管道并行使用CIRCExplorer2和CIRI2来检测，定量和注释circRNA。 这是v0.3.3的流程图：
版本/发行要点
v0.1.0
基本版本
仅支持PE
v0.2.x
SE支持增加了.. PE / SE样本同时处理
envmodules使用的envmodules代替了module load语句
v0.3.x
从hg38到hg19 circRNA注释的查找表已更新...这消除了先前版本中的一对多点击
BSJ被提取为不同的bam文件。
流程图已添加
将slurmjobid添加到日志/错误文件名
v0.3.1在BSJ bam创建时具有显着（> 10X）的性能改进
v0.3.3将BSJ bams拆分为人类和病毒bams，并将其转换为bigwigs
v0.3.4添加了hg38_rRNA_masked_plus_rRNA_plus_viru
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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