文件名称:
multitfa：Python中基于多元热力学的代谢通量分析-源码
开发工具:
文件大小: 8mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-08
详细说明：多TFA
我们介绍了multiTFA，这是一个基于多变量热力学的Python代谢通量分析软件包。 该框架利用了React的吉布斯自由能协方差矩阵，利用热力学约束条件严格限制了代谢模型。 它代表了对描述的以前的热力学代谢通量分析（tMFA）方法的改进。
此实现需要使用COBRA模型作为输入，以及其他隔室条件和代谢物浓度。 它允许用户在COBRA模型上执行各种热力学分析，例如热力学代谢通量分析，变异性分析或通量采样。 请参阅下面的更多详细信息。
安装
从PyPI安装multitfa很简单：（我们建议使用）。
pip install multitfa
要从源代码安装，
git clone https://github.com/biosustain/multitfa.git
cd multitfa
pip install .
我们强烈建议安装 。 尽管我们支持求解器，但我们注意到它在
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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