文件名称:
SARS-CoV2-variant-calling-example：一个具有教育意义的示例，该示例使用SARS-CoV2基因组，使用带有短读Illumina数据的调用变体-源码
开发工具:
文件大小: 47kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-08
详细说明：SARS-CoV2变量调用示例
该存储库包含用于对SARS-CoV2数据执行示例变体调用分析的代码和指令。 分析中使用的所有数据均可公开获得。
步骤1
下载并安装
第2步
克隆此存储库：
git clone https://github.com/davidecarlson/SARS-CoV2-variant-calling-example.git
第三步
使用提供的环境文件，使用此分析中所需的软件创建新的conda环境：
conda env create -f environment.yaml
步骤4
从下载fasta格式的SARS-CoV2参考基因组（登录号NC_045512.2）
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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