文件名称:
metDataModel:代谢组学的数据模型,方位角DB的实用程序-源码
开发工具:
文件大小: 2mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-08
详细说明:metDataModel,基于质谱的代谢组学的数据模型
我们的目标是定义最小的数据模型集,以促进计算代谢组学的互操作性。 该软件包将列出基本概念和数据结构,然后我们可以将它们导入其他项目,并通过继承扩展到更专业的类。
在相关领域中已经进行了广泛的软件开发。 XCMS生态系统( )是数据预处理的主要示例。 Escher项目( )演示了新陈代谢的建模。 科学的发展依赖于实验测量和理论建模的紧密相互作用,两者应该相互促进。 但是,两者之间在代谢组学上存在明显的差距。 例如,Escher中的元素质量表(在1.7.3版中进行了检索)具有平均质量,但质谱仪可测量同位素质量。 许多软件程序已经具有出色的数据模型和数据结构。 但是,从基础知识开始更容易重用数据模型,因此,这个项目可以选择复杂性。
核心数据结构
metabolic model
compound
reaction
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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