文件名称:
实验室生物信息学：大学工作。 适用于长DNA序列的近似比对仪。 通过最小化器和MinHash从k-mers估计Jaccard相似度，然后将其用作序列身份代理-源码
开发工具:
文件大小: 1mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-06
详细说明：将长读映射到大型参考数据库
这是FER（ ）上的生物信息学课程的一个项目。
描述实现算法的论文可以在 找到，其C ++实现。 随着作者对算法的改进，C ++实现似乎与本文的描述有所不同。
安装
该程序的依赖项全部捆绑在./pom.xml ，因此将自动下载。 您只需要在计算机上安装Maven。 从项目根目录运行mvn package应该足以将程序安装在./target下。
运行程序
该程序需要两个参数，即FASTA文件格式的引用和查询（提供的FASTA文件不应包含任何注释）。
您可以通过发出以下命令来运行程序：
java -jar ./target/bioinf-1.0-SNAPSHOT
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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