文件名称:
pymolecule:分子查看器[正在进行中]-源码
开发工具:
文件大小: 36kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-01-30
详细说明:高分子
分子观察者
概要
用不同的颜色绘制原子并将它们放置在不同的空间位置,从而获得一个分子。 为此,您需要知道坐标,这就是为什么使用化学专家系统Open Babel的原因,因此需要将其作为必备软件包安装在系统上,才能成功运行以下脚本:
apt-get install python-openbabel
使用它,您可以将SMILES公式转换为原子坐标列表。 可以在维基百科有关各种物质的文章中找到SMILES。
For example, glucose: OC[CH]1OC(O)[CH](O)[CH](O)[CH]1O.
And its coordinates:
O3 3.08232699168 1.41136753836 1.97383867659
C3 2.63605783234 0.116724346362 2.37092125466
C3 2.87897272901 -0.854338624684 1.21070216538
H 2.47296741411 -0.36351143938 0.319191621385
O3 4.29331227545 -1.03408
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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