文件名称:
nextflow：用于数据驱动的计算管道的DSL-源码
开发工具:
文件大小: 8mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-01-30
详细说明：“数据流变量在并发编程中表现出色”
快速概述
Nextflow是一个生物信息学工作流管理器，可用于开发可移植和可复制的工作流。 它支持在各种执行平台上部署工作流，包括本地，HPC调度程序，AWS Batch，Google Cloud Life Sciences和Kubernetes。 此外，它通过对Conda，Docker，Singularity和模块的内置支持，提供了对管理工作流依赖性的支持。
内容
基本原理
随着大数据的兴起，对大型数据集进行分析和运行实验的技术变得越来越必要。
并行化和分布式计算是解决此问题的最佳方法，但是生物信息学界常用的工具通常缺乏对这些技术的良好支持，或者提供的模型与生物信息学领域的特定要求非常不匹配，并且大多数时间，需要了解复杂的工具或低级API。
Nextflow框架基于数据流编程模型，该模型极大地简化了并行和分布式管道的编写，而不会增加不必要的复杂性，并使您专注于数据流，即应用程序/算法的功能逻辑。
它还没有成为另一种管道脚本语言的目的，但是它基于Linux平台是数据科学的通用语言这一思想而构建，因为它提供了许多简单的命令行和脚本工具，它们本身功
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