文件名称:
cgranges：一个CC ++库，用于快速间隔重叠查询（带有“ bedtools coverage”示例）-源码
开发工具:
文件大小: 63kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-01-28
详细说明：介绍
cgranges是一个用于基因组间隔重叠查询的小型C库：给定一个基因组区域r和一组区域R ，在R中查找与r重叠的所有区域。 尽管此库基于（一种众所周知的数据结构），但就我们所知，cgranges的核心算法与所有现有实现都不同。 具体来说，cgranges中的间隔树被隐式编码为普通排序数组（类似于但打包方式不同）。 树的遍历是通过在数组索引之间跳转来实现的。 这种处理使cgranges非常有效且紧凑。 核心算法可以用大约50行C ++代码实现，也比其他代码短得多。 有关详细信息，请参见的代码注释。
用法
使用BED覆盖范围进行测试
出于测试目的，此存储库使用实现了工具。 源代码位于目录中。
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
相关说明
- 本站资源为会员上传分享交流与学习,如有侵犯您的权益,请联系我们删除.
- 本站是交换下载平台，提供交流渠道，下载内容来自于网络，除下载问题外，其它问题请自行百度。
- 本站已设置防盗链，请勿用迅雷、QQ旋风等多线程下载软件下载资源，下载后用WinRAR最新版进行解压.
- 如果您发现内容无法下载，请稍后再次尝试；或者到消费记录里找到下载记录反馈给我们.
- 下载后发现下载的内容跟说明不相乎，请到消费记录里找到下载记录反馈给我们，经确认后退回积分.
- 如下载前有疑问，可以通过点击"提供者"的名字，查看对方的联系方式，联系对方咨询.
