文件名称:
APA-Scan:检测和可视化带注释的和潜在的替代聚腺苷酸化事件-源码
开发工具:
文件大小: 346kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-04-02
详细说明:APA扫描
APA-Scan在两种不同的生物学条件下检测基因下游3'-UTR中潜在的替代性聚腺苷酸化(APA)事件。
安装
APA-Scan是一个python工具,可以直接从github下载。 必须在用户计算机上安装Python(3.0或更高版本)才能运行APA-Scan。 它可以在Windows,Linux和Mac平台上运行。
用户需要运行特定文件APA-scan.py来演示APA事件。
$ python3 APA-scan.py
要为任何选定的3'-UTR区域生成图,用户需要运行makePlots.py并以特定模式提供输入:chromName:geneName:start-end
$ python3 Make-plots.py
用户手册
可以在github 上找到APA-Scan的用户手册。
引文
请使用以下信息引用...(稍后添加)
联系作者
奈玛·艾哈迈德·法赫米(Naim
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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