开发工具:
文件大小: 1mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-04-01
详细说明:fgsea
fgsea是用于快速预排名基因集富集分析(GSEA)的R包。 该软件包可以快速准确地为一组基因集计算任意低的GSEA P值。 P值估算基于自适应多级拆分蒙特卡洛方案。 有关算法的详细信息,请参见。
完整的插图可以在以下位置找到: :
安装
fgsea是R / Bioconductor的一部分,可在Linux,macOS和Windows平台上使用。 有关安装说明和更多详细信息,请参阅
可以使用devtools软件包从GitHub安装最新版本的fgsea ,这可能需要花费几分钟的时间来安装所有依赖项:
library(devtools)
install_github("ctlab/fgsea")
快速运行
加载库
library(data.table)
library(fgsea)
library(ggplot2)
加载示例途径和基因水平统计数据:
data(exam
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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