文件名称:
scMappR:scMappR开发包-源码
开发工具:
文件大小: 673kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-04-01
详细说明：单单元格映射器（scMappR）
达斯汀·索科洛夫斯基（Dustin Sokolowski）：Dickin-dot-sokolowski-at-sickkids-dot-ca
日期：03/31/2021
描述
scMappR的主要功能
适用于pre-print的scMappR R软件包的说明。 单细胞映射仪（scMappR）R软件包包含一套生物信息学工具，这些工具可将实验相关的细胞类型特定信息提供给差异表达基因（DEG）列表。 函数scMappR_and_pathway_analysis对DEG进行排名，以生成称为细胞加权倍数变化（cwFold-change）的细胞类型特异性评分。 cw倍数变化是通过大量差异分析确定的原始倍数变化，然后通过DEG的细胞类型特异性和输入样品的细胞类型比例进行缩放。
运行scMappR_and_pathway_analysis
用户输入DEG列表（基因名称，
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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